% Soubory musí být v kódování, které je nastaveno v příkazu \usepackage[...]{inputenc}

\documentclass[%        Základní nastavení
%  draft,    				  % Testovací překlad
  12pt,       				% Velikost základního písma je 12 bodů
  a4paper,    				% Formát papíru je A4
  oneside,      			% Jednostranný tisk
	%twoside,      			% Dvoustranný tisk (kapitoly a další důležité části tedy začínají na lichých stranách)
	unicode,						% Záložky a metainformace ve výsledném  PDF budou v kódování unicode
]{report}				    	% Dokument třídy 'zpráva', vhodná pro sazbu závěrečných prací s kapitolami

\usepackage[dvipsnames]{xcolor}

\usepackage[utf8]		  %	Kódování zdrojových souborů je UTF-8
	{inputenc}					% Balíček pro nastavení kódování zdrojových souborů

\usepackage[				% Nastavení geometrie stránky
	bindingoffset=10mm,		% Hřbet pro vazbu
	hmargin={25mm,25mm},	% Vnitřní a vnější okraj
	vmargin={25mm,34mm},	% Horní a dolní okraj
	footskip=17mm,			  % Velikost zápatí
	nohead,					      % Bez záhlaví
	marginparsep=2mm,		  % Vzdálenost marginálií
	marginparwidth=18mm,	% Šířka marginálií
]{geometry}

%\usepackage{sectsty}
	%přetypuje nadpisy všech úrovní na bezpatkové, kromě \chapter, která je přenastavena zvlášť v thesis.sty
%	\allsectionsfont{\sffamily}

\usepackage{graphicx} % Balíček 'graphicx' pro vkládání obrázků
											% Nutné pro vložení logotypů školy a fakulty

\usepackage[          % Balíček 'acronym' pro sazby zkratek a symbolů
	nohyperlinks				% Nebudou tvořeny hypertextové odkazy do seznamu zkratek
]{acronym}						
											% Nutné pro použití prostředí 'acronym' balíčku 'thesis'

\usepackage[hyphens]{url}

\usepackage[
	breaklinks=true,		% Hypertextové odkazy mohou obsahovat zalomení řádku
	hypertexnames=false % Názvy hypertext. odkazů budou tvořeny nezávisle na názvech TeXu
]{hyperref}						% Balíček 'hyperref' pro sazbu hypertextových odkazů
											% Nutné pro použití příkazu 'pdfsettings' balíčku 'thesis'

\usepackage{pdfpages} % Balíček umožňující vkládat stránky z PDF souborů
                      % Nutné při vkládání titulních listů a zadání přímo
                      % ve formátu PDF z informačního systému

\usepackage{enumitem} % Balíček pro nastavení mezerování v odrážkách
  \setlist{topsep=0pt,partopsep=0pt,noitemsep} % konkrétní nastavení

\usepackage{hyperref} % umožňuje \autoref{•} - pro vysázení slov Figure, Table atd.

\usepackage[binary-units]{siunitx}
\DeclareSIUnit{\sample}{S}
\DeclareSIUnit{\ppm}{ppm}

% toto by mělo utišit warningy o underfull hboxech v seznamu literatury
% čas od času vypnout a zkontrolovat, zda to neutišuje i jiné warningy!!
\usepackage{etoolbox}
\apptocmd{\sloppy}{\hbadness 4000\relax}{}{}

\Urlmuskip=0mu  plus 2mu

\usepackage{csquotes}

\let\s\mathrm

\usepackage{cmap} 		% Balíček cmap zajišťuje, že PDF vytvořené `pdflatexem' je
											% plně "prohledávatelné" a "kopírovatelné"

\usepackage{upgreek}	% Balíček pro sazbu stojatých řeckých písmem
											%% např. stojaté pí: \uppi
											%% např. stojaté mí: \upmu (použitelné třeba v mikrometrech)
											%% pozor, grafická nekompatibilita s fonty typu Computer Modern!
                      
\usepackage{amsmath} %balíček pro sabu náročnější matematiky    
\usepackage{mathtools} %balíček pro sabu náročnější matematiky   
\usepackage{amssymb}        

% použito pro otočené přílohy
\usepackage{rotating}  
\usepackage{caption}

\usepackage{dirtree}

% tabulky
\usepackage{booktabs}  
\usepackage{multirow} 

\usepackage[notmath]{sansmathfonts}

% support pro landscape orientaci
\usepackage{pdflscape}
\usepackage{afterpage}

% dings pro fajfky/křížky atp
\usepackage{pifont}

\usepackage[T1]{fontenc} % To switch to the T1 encoding
\usepackage{lmodern} % To switch to Latin Modern
\rmfamily % To load Latin Modern Roman and enable the following NFSS declarations.
% Declare that Latin Modern Roman (lmr) should take
% its bold (b) and bold extended (bx) weight, and small capital (sc) shape, 
% from the corresponding Computer Modern Roman (cmr) font, for the T1 font encoding.
\DeclareFontShape{T1}{lmr}{b}{sc}{<->ssub*cmr/bx/sc}{}
\DeclareFontShape{T1}{lmr}{bx}{sc}{<->ssub*cmr/bx/sc}{}

\usepackage{dirtree}	% sazba adresářové struktury
                      % vhodné pro prezentaci obsahu elektronické přílohy (např. CD)

\usepackage[formats]{listings}	% Balíček pro sazbu zdrojových textů
\lstset{              % nastavení
%	Definice jazyka použitého ve výpisech
%    language=[LaTeX]{TeX},	% LaTeX
%	language={Matlab},		% Matlab
	language={C},           % jazyk C
    basicstyle=\ttfamily,	% definice základního stylu písma
    tabsize=2,			% definice velikosti tabulátoru
    inputencoding=utf8,         % pro soubory uložené v kódování UTF-8
		columns=fixed,  %fixed nebo flexible,
		fontadjust=true %licovani sloupcu
    extendedchars=true,
    literate=%  definice symbolů s diakritikou
    {á}{{\'a}}1
    {č}{{\v{c}}}1
    {ď}{{\v{d}}}1
    {é}{{\'e}}1
    {ě}{{\v{e}}}1
    {í}{{\'i}}1
    {ň}{{\v{n}}}1
    {ó}{{\'o}}1
    {ř}{{\v{r}}}1
    {š}{{\v{s}}}1
    {ť}{{\v{t}}}1
    {ú}{{\'u}}1
    {ů}{{\r{u}}}1
    {ý}{{\'y}}1
    {ž}{{\v{z}}}1
    {Á}{{\'A}}1
    {Č}{{\v{C}}}1
    {Ď}{{\v{D}}}1
    {É}{{\'E}}1
    {Ě}{{\v{E}}}1
    {Í}{{\'I}}1
    {Ň}{{\v{N}}}1
    {Ó}{{\'O}}1
    {Ř}{{\v{R}}}1
    {Š}{{\v{S}}}1
    {Ť}{{\v{T}}}1
    {Ú}{{\'U}}1
    {Ů}{{\r{U}}}1
    {Ý}{{\'Y}}1
    {Ž}{{\v{Z}}}1
}

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%%%%%      Definice informací o dokumentu             %%%%%%%%%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

\input{nastaveni}  % do tohoto souboru doplňte údaje o sobě, druhu práce, názvu...

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%%%%%     Nastavení polí ve Vlastnostech dokumentu PDF      %%%%%%%%%%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%% Při načteném balíčku 'hyperref' lze použít příkaz '\pdfsettings':
\pdfsettings
%  Nastavení polí je možné provést také ručně příkazem:
%\hypersetup{
%  pdftitle={Název studentské práce},    	% Pole 'Document Title'
%  pdfauthor={Autor studenstké práce},   	% Pole 'Author'
%  pdfsubject={Typ práce}, 						  	% Pole 'Subject'
%  pdfkeywords={Klíčová slova}           	% Pole 'Keywords'
%}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

\pdfmapfile{=vafle.map}

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%%%%%%%%%%       Začátek dokumentu               %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\begin{document}
\pagestyle{empty} %vypnutí číslování stránek

%% Vložení desek 
%\includepdf[pages=1]%  buďto generovaných informačním systémem
%  {pdf/student-desky}% název souboru nesmí obsahovat mezery!
%% NEBO vytvoření desek z balíčku
\makecover
%%
\oddpage % při dvojstranném tisku přidá prázdnou stránku
% kazdopádně ale:
\setcounter{page}{1} %resetovaní čítače stránek -- desky do číslování nezahrnujeme

%% Vložení titulního listu
%\includepdf[pages=1]%    buďto generovaného informačním systémem
%  {pdf/student-titulka}% název souboru nesmí obsahovat mezery!
%% NEBO vytvoření titulní stránky z balíčku
\maketitle
%%
\oddpage  % při dvojstranném tisku se přidá prázdná stránka
   
%% Vložení zadání
\includepdf[pages=1]%   buďto generovaného informačním systémem
  {pdf/zadani_en}% název souboru nesmí obsahovat mezery!
\includepdf[pages=1]%   buďto generovaného informačním systémem
  {pdf/zadani_cz}
%% NEBO lze vytvořit prázdný list příkazem ze šablony
%\patternpage{}%
%	{\sffamily\Huge\centering ZDE VLOŽIT LIST ZADÁNÍ}%
%	{\sffamily\centering Z~důvodu správného číslování stránek}
%%
\oddpage% při dvojstranném tisku se přidá prázdná stránka

%% Vysázení stránky s abstraktem
\makeabstract

%% Vysázení stránky s rozšířeným abstraktem
% (týká se pouze bc. a dp. prací psaných v angličtině, viz Směrnice rektora 72/2017)
\sffamily
\include{text/extended_abstract}

%%% Vysázení citace práce
\makecitation 

%%% Vysázení prohlaseni o samostatnosti
\makedeclaration

%%% Vysázení poděkování
\makeacknowledgement

\rmfamily

%%% Vysázení obsahu
\tableofcontents

%%% Vysázení seznamu obrázků
% (vynechejte, pokud máte dva nebo méně obrázků)
\listoffigures

%%% Vysázení seznamu tabulek
% (vynechejte, pokud máte dvě nebo méně tabulek)
\listoftables

%%% Vysázení seznamu výpisů kódu
% (vynechejte, pokud máte dva nebo méně výpisů)
%\lstlistoflistings

\cleardoublepage\pagestyle{plain}   % zapnutí číslování stránek

%Pro vkládání kapitol i příloh používejte raději \include než \input
%%% Vložení souboru 'text/uvod.tex' s úvodem
\include{text/introduction}

\include{text/lidar_theory}

\include{text/tdcs}

\include{text/ilo_theory}

\include{text/ilo_modelling}

\include{text/ilo_design}

%%% Vložení souboru 'text/zaver' se závěrem
\include{text/summary}

%%% Vložení souboru 'text/literatura' se seznamem zdrojů
\include{text/literatura}

%%% Vložení souboru 'text/zkratky' se seznam použitých symbolů, veličin a zkratek
\include{text/zkratky}

%%% Začátek příloh
\appendix

%%% Vysázení seznamu příloh
% (vynechejte, pokud máte dvě nebo méně příloh)
\listofappendices
\addtocontents{toc}{\protect\value{tocdepth}=-1}
%%% Vložení souboru 'text/prilohy' s přílohami
% Obvykle je přítomen alespoň popis co najdeme na přiloženém médiu
\include{text/prilohy}

\end{document}