ERLICH, L. Kalibrace fluorescenčního optického mikroskopu s pomocí elektronového obrazu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2023.
Celkově považuji předloženou práci za velmi kvalitní. Student navrhl a vytvořil kalibrační vzor určený pro kalibraci fluorescenčního mikroskopu pomocí obrazu z elektronového mikroskopu. Dále navrhl a implementoval kalibrační metodu, která kopíruje tradiční přístup k registraci obrazu založený na detekci významných bodů v obraze a odhadu homografie s využitím metody RANSAC. Detektory i deskriptory významých bodů student upravil/vytvořil nové pro daný scénář. Výsledek, že odhadnutá projektivní transformace obvykle dostačuje ke korekci zkreslení optického mikroskopu je překvapivý.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Informace k zadání | Zadání práce považuji za mírně náročnější. Jedná se o standardní problematiku tradičně řešenou v počítačovém vidění, aplikační přesah do elektronové a fluorescenční mikroskopie však náročnost zvyšuje. Student dle mého názoru zadání splnil a odvedl kvalitní inženýrskou práci. | ||
| Práce s literaturou | Student si aktivně sám vyhledával zdroje, většina z citovaných materiálů jsou kvalitní články. | ||
| Aktivita během řešení, konzultace, komunikace | Jedná se o firemní zadání Thermo Fisher Scientific Brno, kde student práci částečně konzultoval. Konzultace s vedoucím práce probíhaly dle dohody nepravidelně, student obvykle dodával dohodnutá týdenní hlášení a na schůzky přicházel připraven. | ||
| Aktivita při dokončování | Finální obsah technické zprávy nebyl s vedoucím práce před odevzdáním nijak zásadně konzultován, s výjimkou několika drobností. | ||
| Publikační činnost, ocenění |
Práce dobře shrnuje problematiku mikroskopie a popisuje výskyt různých chyb obrazu. Dále popisuje techniky jak tyto chyby minimalizovat a testuje jejich efektivitu na vlastním datasetu vzorků. Navržené metody jsou dále vylepšeny a uvedeny do praktického použití. Z těchto důvodů navrhuji hodnotit práci stupněm Velmi dobře.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Náročnost zadání | Zadání považuji za průměrně náročné téma s reálnými implikacemi v průmyslu. | ||
| Rozsah splnění požadavků zadání | Zadání považuji za splněné v plné míře | ||
| Rozsah technické zprávy | Rozsah práce je v normě. Text zahrnuje vše nutné k porozumění práce. | ||
| Prezentační úroveň technické zprávy | 85 | Prezentační úroveň práce je na velmi dobré úrovni. Rozdělení do kapitol je vhodně zvoleno a napomáhá porozumění textu. Technické detaily jsou podrobně vysvětleny a doprovázeny velmi výstižnými vizualizacemi. | |
| Formální úprava technické zprávy | 85 | Po typografické stránce je text v pořádku a obsahuje pouze menší množství problémů. Mezi tyto patří například chybějící odkazy na některé figury (Obr. 2.6) a chybějící mezery mezi slovy. Zkratky by bylo také vhodné explicitně definovat - např. Elektronový Mikroskop (EM). Pro přehlednost textu bych také některé poznámky pod čarou integroval přímo do textu. Po jazykové stránce hodnotím text také pozitivně, avšak s omezenou znalostí Slovenského jazyka. | |
| Práce s literaturou | 80 | Literární prameny jsou v práci vhodně zohledněny. Odkazované články jsou převážně z robustních vědeckých konferencí a žurnálů. Využité elektronické zdroje ve formě dokumentací a knihoven jsou vždy korektně citovány. Z textu je téměř vždy jasné které části vypracoval autor a které byly převzaty. Výjimku tvoří některé obrázky - např. 2.1, 2.2 a 2.4 - u kterých není jasný zdroj. | |
| Realizační výstup | 90 | Realizační výstupy práci považuji za signifikantní. Souhrn problematiky mikroskopie a chyb které se v ní objevují jsou jasně vysvětleny. Dále autor vytvořil dataset vzorků, které lze použít pro testování kalibračních metod i v další práci. Na tomto datasetů následně provedl testování metod pro mapování kalibračního vzoru a odhadu parametrů modelu zkreslení. Tyto metody vyhodnotil a navrhl také vlastní metodu pro odhad modelu zkresnelí pomocí zbytkového zkreslení. | |
| Využitelnost výsledků | Výsledky práce jsou využitelné nejen v praktických aplikacích firmy Termo Fisher, ale dateset lze také použít v dalším výzkumu který se tímto tématem bude zabývat. |
eVSKP id 147473