KOŇAŘÍKOVÁ, K. Srovnávací analýza výskytu a evolučního významu Z-DNA struktur v lidském genomu a genomech různých virů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2025.
Tato bakalářská práce se zabývá srovnávací analýzou výskytu a evolučního významu Z-DNA struktur v lidském genomu a genomech různých virů. Pomocí nástroje Z-DNA hunter autorka identifikovala potenciální Z-DNA sekvence a analyzovala jejich distribuci a funkční význam. Z-DNA struktury byly nalezeny v blízkosti regulačních oblastí, což naznačuje jejich možnou roli v genové expresi a interakcích s virovými genomy. Práce přispívá k hlubšímu porozumění biologickým funkcím Z-DNA a jejich významu pro stabilitu genomu a buněčné procesy. Práce splňuje všechny požadavky kladené na bakalářskou práci. Studentka se velmi úspěšně začlenila do pracovního kolektivu skupiny a výborně pracovala na bioinformatické analýze genomových sekvencí, pouze psaní vlastní práce bylo poněkud pomalejší a finální verze byla připravena v poslením možném termínu. Doporučuji ji k obhajobě a navrhuji hodnocení výborně (A).
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | B | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A | ||
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | B | ||
| Využití poznatků z literatury | A |
Bakalárska práca na tému „Srovnávací analýza výskytu a evolučního významu Z–DNA struktur v lidském genomu a genomech různých virů“ vypracovaná študentkou Klárou Koňaříkovou predstavuje kvalitne spracovaný vedecký text, ktorý napĺňa všetky stanovené ciele zadania. Práca zahŕňa rozsiahlu literárnu rešerš zameranú na charakteristiku Z-DNA ako alternatívnej DNA štruktúry, jej biologický význam, možnosti detekcie a metódy bioinformatickej analýzy. Experimentálna časť práce je založená na analýze ľudského genómu (T2T verzia) a viacerých reprezentantov DNA vírusov pomocou nástroja Z-DNA Hunter. V práci sú uvedené postupy spracovania dát vrátane anotácií a vizualizácií výskytu Z-DNA v rôznych genómových oblastiach. Výsledky sú spracované pomocou tabuliek a grafov, ktoré prehľadne ilustrujú frekvenciu, dĺžku a lokalizáciu predikovaných Z-DNA segmentov. Autorka zároveň porovnáva výskyt Z-DNA v rôznych vírusových skupinách z hľadiska genómovej dĺžky, typu DNA a schopnosti infikovať človeka. Práca je po obsahovej stránke rozsiahla a odborne zvládnutá. V teoretickej časti sa čitateľ zrozumiteľne oboznamuje s komplexnými štruktúrami DNA a bioinformatickými nástrojmi. Text je jazykovo dobre spracovaný a plynulý. Záver práce je jasný, nadväzuje na získané výsledky a študentka v ňom zhrnula hlavné poznatky aj potenciál ďalšieho výskumu. Medzi drobné nedostatky patrí nižšia dôslednosť pri citovaní – niektorým odsekom absentuje literárny zdroj. Taktiež čitateľnosť niektorých obrázkov a grafov by mohla byť vyššia a v niektorých prípadoch chýbajú vysvetlenia skratiek používaných v grafoch. Formálna stránka práce trpí drobnými typografickými nedostatkami – chýba členenie odsekov, nesprávne využitie nadpisov 4. kategórie, číslovanie strán, využitie kurzívy a nedôsledné zaokrúhľovanie čísel vo výsledkoch. Tieto formálne nedostatky však nijako neznižujú vedecký prínos ani kvalitu spracovania. Práca preukazuje, že študentka plne porozumela problematike, je schopná samostatne pracovať s odbornou literatúrou aj s dátami a má prehľad o aktuálnom výskume v oblasti molekulárnej biológie a bioinformatiky. Výsledky sú interpretované vecne, podporené literatúrou a práca je zakončená uceleným návrhom ďalšieho výskumu. Z uvedených dôvodov odporúčam prácu k obhajobe a hodnotím ju známkou A – výborne.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Využití literatury a její citace | B | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
eVSKP id 162058