GRUND, P. Softwarové řešení systému FLIM s využitím pulsního laditelného laseru v konfokální mikroskopii [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.
Rešerše představená v práci je rozsahem stručná, skladba a řazení kapitol je logická. Jednotlivé kapitoly ale ne vždy dobře vystihují rozebíranou problematiku a některé teoretické poznatky a ukázky působí neaktuálně. Část rešerše je věnována popisu programového prostředí Fiji, ve kterém student následně realizuje programové vybavení. Zcela chybí část, ve které by měla být vysvětlena celá teoretická podstata doby života fluorescence, jejího měření a hodnocení; taktéž související popis postupu, který využívá použitý konfokální mikroskop k získání sady snímků pro další využití v hodnocení doby života fluorescence, kde by byly vidět možnosti a limity systému, který student realizoval v praktické části. Celkově je rozsah práce velmi malý. V další, závěrečné části, práce jsou prezentovány způsob akvizice snímků metodou konfokální mikroskopie a popis postupu konstrukce pseudobarevných snímků u realizace metody kvazi FLIM napodobující standardní metodu FLIM. A to jen na necelých osmi stranách. Jednotlivé výsledky – výstupní pseudobarevné snímky znázorňující změny doby života fluorescence - jsou spolu se vstupními sadami snímků a schématy použitých algoritmů obsaženy až v příloze. Jednotlivé kroky algoritmu nejsou v práci popsány. Chybí jakákoli diskuse, ve které by autor objasnil úspěšnost algoritmů a prováděných analýz. Předpokládanou stěžejní částí práce mělo být programové vybavení pro realizaci metody kvazi FLIM. To je však představeno jen v základní verzi. Dá se říci, že celkový rozsah zdrojových kódů je 3 stany A4. Zdrojový kód je navíc komentován jen stručně. Program nedisponuje grafickým prostředím, neumožňuje volbu či úpravu parametrů použitých při zpracování (např. hodnoty prahu nebo barev palety), ani užitečnou funkci přepočtu hodnot snímku za účelem zvýraznění kontrastu nebo konkrétních oblastí snímků. Zadání je sice jako celek splněno, ale praktická část je splněna jen na částečné úrovni. Po jazykové a formální stránce je práce na průměrné úrovni. Student vykazoval jen malou aktivitu a soustavné práci a pravidelným konzultacím nevěnoval příliš pozornost. Vzhledem k celkově slabé úrovni práce je zvoleno hodnocení celkem 51 bodů.
Předložená diplomová práce se zabývá tématem analýzy doby života fluorescence biologických vzorků snímaných pomocí konfokálního mikroskopu metodou FLIM. První část práce se zabývá detailním popisem principu konfokální mikroskopie a metody FLIM. Zde chybí, dle zadání požadovaná rešerše využití metody FLIM v buněčné biologii. Je citován pouze jeden zdroj (Becker, W.). Na tento teoretický popis navazuje popis programového prostředí Fiji, které bylo využito k programové realizaci požadovaného úkolu. Celá práce (včetně příloh) má rozsah 60 stran. Popis praktické realizace je pouze na 7 stranách. V práci je popsán postup programové realizace metody kvazi FLIM, jakožto doplňkového modulu pro softwarové prostředí Fiji. Chybí však úplně zhodnocení a diskuse dosažených výsledků. Rovněž chybí srovnání dosažených výsledků s klasickým FLIM systémem. V závěru práce je však uvedeno, že po dohodě s vedoucím bylo srovnání s FLIM systémem vynecháno, protože nebylo možné zajistit adekvátní měření na externím zařízení. Z práce rovněž není patrné, zda student prováděl samostatně experimentální měření v laboratoři či nikoliv a jaké bylo nastavení použitého systému pro získání požadovaných snímků. Po formální stránce je práce na dobré úrovni. Text práce je vhodně formulován a je srozumitelný. Práce obsahuje jen malý počet překlepů a pravopisných chyb. Výtku mám k prezentaci výsledků formou příloh. Odkazování na přílohy je v textu práce matoucí. Výstupy metody mohly být klidně součástí příslušné kapitoly, spolu s diskusí, která v práci chybí. Závěrem konstatuji, že dle uvedených nedostatků lze zadání práce považovat za splněné jen částečně. Oceňuji však, že se studentovi alespoň podařilo vytvořit funkční doplňkový modul k rozhraní Fiji, který lze využít pro další aplikace. Hodnocení: E/55 b.
eVSKP id 81296