VYORALOVÁ, A. Přítomnost a lokalizace lokálních DNA struktur v genomech papilomavirů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.
Ve své bakalářské práci se Andrea Vyoralová zabývala bioinformatickou analýzou sekvencí pro tvorbu G-kvadruplexů a křížových struktur v genomech papilomavirů. Během své práce úspěšně ovládla řadu bioinformatických technik a získala velmi zajímavé výsledky. Bakalářskou práci vypracovala samostatně a prokázala dobrou orientaci v odborné literatuře a schopnost řešit danou problematiku. Její získané zkušenosti jistě využije při dalším studiu. Výsledky byly prezentovány kvalitně a odpovídají úrovni bakalářského studia. Studentku hodnotím jako výbornou – A, ve všech hodnotících kritériích.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A | ||
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | A | ||
| Využití poznatků z literatury | A |
Predložená bakalárska práca študentky Andrei Vyoralové sa zaoberá témou bioinformatickej analýzy prítomnosti a lokalizácie lokálnych DNA štruktúr v genómoch papilomavírusov. Bakalárska práca má 45 stránok a je delená na teoretickú a experimentálnu časť. V teoretickej časti práce autorka pojednáva o danej problematike s využitím odbornej literatúry. Teoretická časť je logicky a prehľadne koncipovaná, výborná kvalita a úroveň jazykového spracovania vypovedajú o prehľade študentky v danej oblasti, ale rozsah rešerše je krátky. Využité literárne zdroje boli prevažne od zahraničních autorov. Teoretická časť poskytuje čitatelovi náhľad do problematiky danej témy, ide o pekne spracovanú a ucelenú literárnu rešerš, ale príliž stručnú. V experimentálnej časti práce sa študentka zaoberá bioinformatickou analýzou genómov vybraných papilomavírusov infikujúcich stavovce a človeka. Genómové sekvencie boli získané z prístupných databáz a boli analyzované na pravdepodobnosť prítomnosti G-kvadruplexov použitím programu G4Hunter a Palindrome analyser. V týchto genómoch boli taktiež analyzované ireverzibilné repetície. Lokalizácie lokálnych štruktúr a taktiež samotné analyzované papilomavírusy boli porovnané medzi sebou a s inými organizmami (Archaea, Bacteria a Homo sapiens). Bioinformatická analýza splnila ciele stanovené v tejto bakalárskej práci. Keďže sa jedná o výlučne bioinformatickú bakalársku prácu, laboratórne experimenty neboli jej súčasťou. Z výsledkovej časti vyplýva, že študentka musela preukázať istú mieru samostnatnosti a schopnosť interpretovať získané bioinformatické výsledky. Výsledky sú pekne a prehľadne spracované do grafov a tabuliek a príslušne okomentované. V závere však chýba návrh ďalšieho možného pokračovania práce a možné následné využitie získaných informácií. Všetky body zadania boli splnené. K práci mám len niekoľko prevažne vecných a formálnych komentárov a doporučení: Komentáre: - V práci je uvedený zoznam príloh, ale samotné prílohy som v práci nenašla. - Na strane č.10 je použitý obrázok č.1 s anglickými názvami. Keďže je celá práca v českom jazyku, mali by byť aj tieto názvy v češtine. - Na strane č.18 je použitý obrázok č.5, ktorý presahuje okraje textu. Vzhľadom k uvedeným skutočnostiam odporúčam prácu na obhajobu a hodnotím stupňom výborný (A).
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Využití literatury a její citace | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B |
eVSKP id 148394