ŠEDÝ, M. Analýza lokalizace inverzních repetic v bakteriálních genomech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2021.
Ve své diplomové práci se Bc. Michal Šedý věnoval frekvence výskytu a lokalizace inverzních repetic v bakteriálních genomech.. V rámci své práce se věnoval nejprve popisu inverzních repetic a křížových struktur v DNA a proteiny, které s nimi interagují. V experimentální části s využitím programu Palindrome finder analyzoval výskyt inverzních repetic v 1627 bakteriálních genomech. Úspěšně zpracoval toho velké množství dat a výsledky přehledně popsal ve své práci. Charakterizoval tak jednotlivé skupiny baktérií dle výskytu inverzních repetic v genomu včetně organismů s extrémně nízkými či vysokými hodnotami. Zajímavá je asociace inverzních repetic v okolí funkčních oblastí genomů, která ukazuje na potenciál využití těchto sekvencí při regulaci genové exprese a celé řady důležitých buněčných procesů. Student kombinovaného studia sice nebyl příliš aktivní v konzultacích nekomunikoval zcela pravidelně, ale před odevzdáním úspěšně zpracoval požadované výsledky a práci kvalitně sepsal. Část jeho výsledků je dokonce podkladem pro připravovanou publikaci, takže celkově hodnotím práci pozitivně a hodnotím ji celkově známkou B (splnění požadavků zadání A, využívání konzultací C, v ostatních parametrech B.)
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | B | ||
| Využití poznatků z literatury | B | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | C | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | B |
Uspokojivě zpracovaná diplomová práce - sice méně rozsáhlá, avšak sepsána srozumitelně, zahrnuje poměrně dobrou literární rešerši i logicky nastavenou experimentální část. Téma je zajímavé a aktuální. Je evidentní, že se student v zadané problematice dostatečně zorientoval. V ohledem na zadání práce by však bylo přínosné důsledněji diskutovat její dopad do potravinářství. Práci doporučuji k obhajobě.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Logické členění práce | B | ||
| Splnění požadavků zadání | B | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | C | ||
| Využití literatury a její citace | B | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B |
eVSKP id 124203