KAMAR, Y. Vyhledávání homologních genů pomocí metod zpracování signálů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.
Studentka Yana Kamar vypracovala stručnou literární rešerši na téma signálových reprezentací DNA sekvencí a metod vyhledávání homologních genů. Následně některé reprezentace naprogramovala spolu s metodami porovnávání signálů několika metrikami a provedla vyhledávání homologních genů na několika kompletních bakteriálních genomech. Od úvodu po závěr má práce 56 stran, vlastní řešení a výsledky jsou popsány na 39 stranách, přičemž 25 stran obsahuje pouze obrázky výsledků, jež měly být spíše umístěny až za závěr jako příloha. Formální stránka práce je na horší úrovni. Vzhledem k tomu, že studentka není rodilá mluvčí, je v práci množství gramatických a stylistických chyb. Text je v některých případech hůře pochopitelný, či zavádějící a odborně nepřesný. Grafická úprava práce je taktéž na horší úrovni. Některé formální nedostatky: chybí číslování stran, zbytečné rozdělení na kapitoly 4 a 5, v kapitole 1 chybí odkazy na literaturu. Je citováno 21 zdrojů, některé zdroje jsou napsány v jiném formátu. Způsob řešení je sice stručně ale srozumitelně popsán. Popis samotných výsledků analýzy je popsán méně srozumitelně a některé aspekty jsou nedostatečně vysvětleny. Např. kapitola 5.2 poslední dva odstavce, není jasné, co znamenají uváděná čísla. Stejně tak na následující straně se hovoří o nastavení prahu pro euklidovskou vzdálenost, přičemž hodnota nastavení není zdůvodněna. Z přiložených obrázků výsledků je v některých případech nemožné vyčíst, ke kterému průběhu patří označené minimum. Práci studentka vypracovávala převážně samostatně, konzultací využívala sporadicky. I přes zmíněné nedostatky, převážně formálního charakteru, obsahuje práce hodnotné výsledky a zadání bylo splněno.
Studentka Yana Kamar se ve své bakalářské práci zabývala vyhledáváním holomogních genů s využitím signálového zpracování. Celkový rozsah práce je 65 stran, z toho 25 stran grafů. V práci se vyskytuje mnoho gramatických a stylistických chyb, rovněž formální nedostatky: počet stran v citaci práce nesouhlasí se skutečným počtem stran; nekonzistentní formátování obsahu práce; chybí seznam obrázků a tabulek; chybí číslování stran; chybné formátování citací. Teoretická část práce nepopisuje dostatečně danou problematiku a není dostatečně podložena kvalitními referencemi (např. první kapitola neobsahuje ani jednu citaci). V textu se vyskytují nepřesné formulace a nesprávné odkazy rovnic. V praktické části byl navržen a testován algoritmus vyhledání genů s využitím korelace, euklidovské a canberrské metriky na signálech kumulované a rozbalené fáze. Autorka však řádně nezdůvodňuje a netestuje volbu stěžejních parametrů a vlastností algoritmu např.: volba typu numerické reprezentace a volba prahu pro identifikaci homologních genů. Autorka splnila zadání, avšak v bodech 1 a 5 nevyužila potenciál zadání. Vyhodnocení analýzy není zcela průkazné a práce je šita horkou jehlou. Vzhledem k závažným formálním i odborným nedostatkům hodnotím stupněm D / 65 b.
eVSKP id 102316