1)Program pro vytvoření databáze dílků se spouští v souboru Main. Již vytvořená databáze dílků je uložena v adresáři "kompletní databáze shluků"

2)Jednotlivé podprogramy aplikace skládání dílků se spouštějí v pořadí "Priprava_dat.m", "Spojovani.m" a "Vizualizace.m". Pro testování lze využít připravených množin obrazů dílků shluku tří a čtyř dílků uložených souborech "databáze shluku čtyř dílků" a "databáze shluku čtyř dílků". Podle toho který shluk chceme testovat se dílky testovacích množin zkopírují do adresáře se zdrojovými soubory. Pro testování shluku čtyř dílků je potřeba ve zdrojovém kódu na řádku 85 a 86 odkomentované řádky a zakomentovány řádky 81 až 83. Pro testování shluku tří dílků se provede zakomentování a odkomentování naopak.