OREL, M. Izolace a průkaz DNA z rostlin významných v potravinářství [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2019.
Cílem práce byla genetická analýza rostlinných druhů, Daucus carota, Capsicum annum, Beta vulgaris a Brassica olearacea, které jsou důležítými plodinami poskytující zeleninu, jako je mrkev, paprika, červená řepa a brokolice. Byly izolovány DNA z příslušných druhů a tyto podrobeny amplifikaci PCR zacílenou na přepisovaný mezerník rDNA. Pomocí restrikční analýzy PCR produktů se podařilo odlišit od sebe všechny čtyři biologické druhy. Student zvládl celou řadu experimentálních metod, jako je isolace DNA, její fluorimetrická a spektrofotometrická kvantifikace, PCR a restrikční štěpení. Za velmi pozitivní považuji studentovu snahu o zvládnutí moderních bioinformatických metod, jež pak v diplomové práci úspěšně aplikoval.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | B | ||
| Využití poznatků z literatury | B | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | B |
Vypracovaná diplomová práce je zaměřena na identifikaci 4 druhů zeleniny (brokolice, červená řepa, mrkev a paprika). DNA byla izolována pomocí dvou metod – klasické fenolové extrakce s CTAB a pomocí magnetických částic. DNA izolovaná oběma postupy byla amplifikována s použitím polymerázové reakce (PCR). Byly použity primery 18S_for a 5,8S_rev specifické pro rostlinnou ribosomální DNA (rDNA). K analýze produktů PCR byla použita restrikční analýza, přičemž bylo testováno použití 8 různých endonukleas. Diplomová práce přináší nové poznatky docílené srovnáním in silico analýzy s výsledky štěpení uvedenými enzymy. Práce je logicky členěna a výsledky diskutovány. K práci mám formální připomínku – vyjádření jednotek koncentrace by mělo být jednotné. Diplomovou práci doporučuji k obhajobě. Otázky k obhajobě a připomínky k práci: Podrobněji charakterizujte použité magnetické částice a uveďte jejich původ. Popište neúplné (parciální) štěpení DNA nukleasami.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Využití literatury a její citace | B | ||
| Úroveň jazykového zpracování | B | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | C | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
eVSKP id 115217