Program je zahájen spuštěním scriptu s názvem START.m, všechny soubory musí být obsaženy v jdné složce.

Popis jednotlivých soborů:

Soubor zacatek - GUI

Soubor (vcely/geneticky/PSO)_gui - script používaný k přizpůsobené filtraci a následné optimalizaci prahu pomocí souborů (vcely/geneticky/PSO)_OTSU

Soubor segmentace - blok pro GUI segmentaci

Soubor filtrace - blok pro GUI přizpůsobenou filtraci

Soubor prizpusobena_filtrace_(vcely/geneticky/PSO) - script k optimalizaci parametrů masky pro přizpůsobenou filtraci

Soubor filtrace_funkce - funkce pro získání fůze parametrických obrazů

Soubor prizpusobeny_filtr - používán k přizpůsobené filtraci k zobrazení testovacího setu v GUI bloku pro přizpůsobenou filtraci

Soubor rekonstrukce - GUI blok pro rekonstrukci

Soubor spojity_(vcely/PSO/spojity_geneticky) - script používaný k rekonstrukci obrazu

Soubor registrace_(vcely/geneticky/PSO) - sctipt používaný k registraci obrazu

Soubor registrace - GUI blok registrace

Soubor sachovnice - funkce pro vytvoření šachovnicového překrytí

Soubor podvzorkovani - funkce pro podvzorkování obrazu

Soubor reprodukce_(rekonstrukce/registrace/otsu/filtrace) - funkce pro křížení a mutaci genetického algoritmu v požadované aplikaci

Soubor (gene/vcely/PSO)_prah - script pro zjištění pouze jediného prahu pro celý testovací set

Soubor prah - pomocná funkce pro zjištění pouze jediného prahu, jsou v ní načteny snímky testovacího setu, segmentováno pomocí prahu a zjištěn průměrný DICE koeficient.

Složka FIRE_zkracene obsahuje několik snímků veřejně dostupné databáze FIRE pro možnost testování.

Složka DRIVE_zkracene obsahuje několik snímků veřejně dostupné databáze DRIVE pro možnost testování.