PACASOVÁ, V. Studium metabolismu polyhydroxyalkanoátů bakterie Rhodospirillum rubrum [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.
Ve své diplomové práci se nejprve Bc. Viktore Alexandra Pacasová věnovala literární rešerši, především se zaměřila na polyhydroxyalkanoáty (PHA), bakteriální kmen Rhodospirillum rubrum a stresovou odpověď bakterií schopných produkce PHA. Cílem práce bylo definovat význam metabolické dráhy PHA cyklu na viabilitu bakteriální kultury R. rubrum exponované vybraným stresovým faktorům (teplota, osmotický stres, UV záření a jiné). Nejprve si studentka optimalizovala kultivační podmínky z hlediska výběru a koncentrace substrátu s ohledem na produkci PHA v čase. Následně studentka stanovila pomocí průtokové cytometrie viabilitu mikrobiálních buněk vystavených environmentálně relevantním stresorům, jak PHA produkujícího kmene R. rubrum, tak i jeho mutantního kmene. V další části experimentální práce se studentka zaměřila na morfologii buněk prostřednictvím elektronové mikroskopie (kryo-SEM a STEM). Velká část práce byla odvedena u samotné optimalizace kultivačních podmínek, jelikož bakteriální kmen R. rubrum disponuje neobyčejně všestranným metabolickým aparátem. Studentka přistupovala k plnění své diplomové práce velice svědomitě a pečlivě. Po velmi krátké době si osvojila potřebné dovednosti a byla schopná samostatně měřit a vyhodnocovat data z průtokového cytometru. Taktéž byla studentka velice aktivní a nápomocná u přípravy vzorků a při měření na elektronových mikroskopech. Výsledkem úspěšné realizace a dostatečné konzultace s vedoucím i konzultantem práce je velmi zdařilá diplomová práce, která bude podkladem pro další navazující experimentální činnost. Celkově diplomovou práci doporučuji k obhajobě a hodnotím známkou A.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Využití poznatků z literatury | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
Diplomová práce studentky Alexandry Pakasové se zabývá studiem metabolismu polyhydroxyalkanoátů u bakterie Rhodospirillum rubrum, optimalizaci kultivačních podmínek a možnému vlivu PHA na stresovou odpověď bakterie. Teoretická část je čtivá, logicky členěná a obsahuje málo chyb a překlepů. Experimentální část dokazuje, že studentka zvládla práci s mikroorganismy i pokročile analytické metody, průtokovou cytometrii a elektronovou mikroskopii. Oceňuji diskusi výsledků s odbornou literaturou. K práci mám pár připomínek. V experimentálni části není uvedeno, odkud pocházi mutantní kmen R. rubrum. Chybí detailní složení SYN FAY médium (v textu lze najít samotné slozeni FAY, avšak již ne následneho SYN FAY. V jakém poměru byly SYN a FAY míchány? Jaké jsou koncentrace jednotlivých složek ve finálních médiích?). V některých kapitolách (3.3.2, 3.5.1) jsou podmínky centrifugace uvedeny v jednotkách rpm a v kap. 3.9 v g. Ačkoliv jsou od kapitoly 4.1.1 a dále uvedeny odchylky, v kap. 4.1 chybí a není možné zjistit, kolik replikátů bylo provedeno (a nebo zda se jedná o biologické replikáty, technické replikáty). V kap. 3.3.2 by bylo vhodné uvést teplotu sušeni vzorků. V kap. 4.3 byl experiment proveden rovnež s mutantním kmenem, avšak výsledky nejsou nikde uvedeny (produkce biomasy a PHA). Studentka splnila všechny dílčí cíle diplomové práce. Práci doporučuji k obhajobě a hodnotím ji známkou A - výborně.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Využití literatury a její citace | A | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
eVSKP id 148955