KASÁKOVÁ, A. Vliv distribuce dávky elektronů na akvizici tomogramu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.
tudentka Anna Kasáková předložila bakalářskou práci na téma Vliv distribuce dávky elektronů na akvizici tomogramu. Práce je pokračováním semestrálního projetku na stejné téma, kde autorka vypracovala literární rešerši na dané problematiky. Zaměřuje se zde na principy metody elektronové mikroskopie a srovnává ji s optickou mikroskopií. Popisuje interakce elektronového svazku se vzorkem jak pro tenké, tak objemné vzorky a přípravu vzorků pro elektronovou mikroskopii. Následně se věnuje elektronovým mikroskopům a jejich jednotlivých částem. Poté se přesouvá k metodám kryo-elektronové mikroskopie, jako je single particle analysis a kryo-elektronová tomografie, jíž se věnuje více do hloubky, protože je předmětem zájmu dané práce. Diskutuje jak princip metody, její využití a strategie pro optimalizaci sběru dat. Následuje experimentální část práce, kde autorka popisuje jednotlivé kroky celého workflow od přípravy vzorků, po akvizici dat a následnou analýzu. V této sekci také představuje parametry, které ovlivňují dávku elektronů a jějich distribuci během akvizice dat. Nasbíraná data a jejich vyhodnocení je dále prezentováno a sekci Results and discussion, kde autorka diskutuje vliv jednotlivých parametrů na kvalitu zrekonstruovaných tomogramů. Na závěr navrhuje případné další experimenty, které by mohly práci ještě dále doplnit a veškeré poznatky shrunuje v závěrečné části práci. Práce je psaná v anglickém jazyce, čímž autorka demonstruje svoje výborné jazykové znalosti. Autorka celou práci vypracovala samostatně, na základě literaturní rešerše získala přehled o dané problematice, což jí umožnilo navrhnout a realizovat dané epxerimenty. Během experimentální činnosti autorka prokázala výborné organizační a komunikační schopnosti, například plánování přípravy vzorků na cryo-FIBu, reservace potřebného systému pro akvizici dat a také schopnost zorientovat se při práci se softwary pro snímání a vyhodnocení dat. Jedná se o velice komplexní problematiku a vyhodnocení dat nebylo snadné, což se do jisté míry promítá ve skutečnosti, že práce se ne vždy čte úplně snadno. Autorka během experimentální činnosti nasbírala veliké množství dat, o která se v diskusi opírá, srovnání s dostupnou literaturou už je ale menší či ukázka dalších tomogramů také chybí. Cíle dané práce však byly splněny a navrhuji celkové hodnocení B.
This bachelor thesis is divided into theoretical and practical part, it contains 78 pages, including 7 pages of listed sources, from which 6 aims from technique study to experiment suggestion, providing and observed facts conclusion is included. For bachelor thesis this topic is very wide - the student prepared large literature review, described all parts not only from the proposed technique - tomography, but also instrumental parts - parts of electron microscope are described. The theoretical part is 45 pages long. In my opinion, it will be beneficial if the student shortens the theoretical part and concentrates more on the experimental description and discussion regarding the evaluation of the experiment. The experimental part includes 107 individually acquired tomograms of vitrified cell structures, which proves the student understood the topic and can work individually at the electron microscope. The fact that the data from these 107 parts has been post-processed by the student ensures full understanding of the topic. Evaluation: The thesis has all the formal qualities, including a long list of references, which are correctly used. The text has a logical structure but is not easy to read. There are many grammatical and formal errors, which can be attributed to the English language used in this thesis and to the fact that the topic is very broad for a bachelor thesis. Nevertheless, in the experimental part, the student showed a high interest in the topic and the thesis. A broader discussion of the experimental results will be beneficial for the next thesis. The student fulfilled the definition of a bachelor thesis - I recommend the work as a bachelor thesis. Proposed final grade: B consists of two grades: for the written part, grade C, for the experimental part, grade A.
eVSKP id 150804